Illumina公布新一代測序儀發展大計
近日，Illumina公司公布了其新一代測序儀Genome Analyzer系統的發展路線，計劃在2009年實現每次運行獲得超過95 GB的高質量數據。該路線勾勒出試劑、算法和硬件的升級，將會顯著改善準確率、讀長、數據密度和易用性。Illumina預計今年底單個流動室能產生人類基因組的25倍覆蓋度，而人類基因組的測序費用降低至1萬美元以下。
以Genome Analyzer現在的配置，每次運行能產生15 GB以上的高質量數據。以此為基礎， 2009年Genome Analyzer的性能會提升6倍以上。這些改進將分幾個階段進行，并包括以下元素：
• 試劑改良，包括使用全新的聚合酶，讓運行速度更快，配對片斷超過2×100 bp。這些改進有望提高測序準確性，實現2×100配對末端閱讀片斷的準確性超過98.5%，2×50 配對末端片斷則超過99.9%。
• 硬件升級，包括流動室支架改進和試劑冷卻器增容，不僅能增加產量，還能實現至少100個循環的無人值守自動化。這些硬件將組成Genome Analyzer 升級試劑盒，現在的用戶也能立即訂購，享受升級的樂趣。
• 算法改進，包括檢測簇的新方法，將讓高密度流動室的產量提高80%，并改善堿基檢出的準確性。
• 數據密度增加，通過利用1微米及亞微米特征的半有序陣列。這些有序的陣列，以及讀長的增加，有望在每次運行中分別產生55和95 GB的數據。
這些改進不僅增加了Genome Analyzer的產量，降低了測序費用，還大大擴展了它的應用空間。Illumina生命科學部的副總裁Joel McComb表示：“作為應用最廣的新一代測序平臺，Genome Analyzer已發表論文200多篇，并讓世界各地的科學家快速經濟地進行突破性的研究。經過2009年的系統升級，我們預計Genome Analyzer將繼續成為眾多應用中的靈活工具，包括大規模全基因組分析、從頭測序、宏基因組學等，并將加快人類健康、生物多樣性和環境的探索速度。”
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